2011年4月22日 星期五
1. Motif finding - MEME
http://meme.nbcr.net/meme4_6_1/cgi-bin/meme.cgi
2. Get results
3. Pick TOMTOM icon for known transcription factor identify.
1. Download blast program from follow web
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
2. Download "NR" database from same web
3. Install ncbi-blast-2.2.25+-win32.exe
4. In windows "command mode " -->
cd C:\Program Files\NCBI\blast-2.2.25+\bin
5. Create XXX database
makeblastdb.exe -in XXX.fsa -dbtype nucl -out XXX.out
** nulc: nucleotide prot: protein
6. Nucleotide Blast
blastn.exe -query test.fsa -db XXX.out -out test.out
or
blastn.exe -query test.fsa -db XXX.out -outfmt 6 -out test.out
or
blastn.exe -query test.fsa -db XXX.out -num_alignments 3 -num_descriptions 3 -evalue 1e-20 -out test.out
**test.fsa can use multiple sequences
Other information:
BLAST Command Line Applications User Manual --> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1763/
標籤: Bioinfo
2011年4月13日 星期三
Analysis of data from experimentally determined antigenic sites on proteins has revealed that the hydrophobic residues Cys, Leu and Val, if they occur on the surface of a protein, are more likely to be a part of antigenic sites. (Ref: memboss)
標籤: Bioinfo
2011年3月31日 星期四
1. cd C:\Program Files\Microsoft Office\Office14
2. cscript ospp.vbs /sethst:127.X.X.X
3. cscript ospp.vbs /act
標籤: Office
2011年3月30日 星期三
TTEST(array1,array2,tails,type)
Array1 是第一資料組。
Array2 是第二資料組。
Tails 指定分配的尾數。如果 tails = 1,則 TTEST 使用單尾分配,如果 tails = 2,則 TTEST 使用雙尾分配。
Type 是所要執行的 t-檢定種類。
如果 TYPE 等於 執行的檢定種類
1 成對
2 具有相同變異數的二個樣本
3 具有不相同變異數的二個樣本
標籤: Office
2011年3月8日 星期二
1. 於[電腦管理]中,手動啟用Administrator 帳號
2. 以Administrator帳號登入
3. Regedit --> 修改
於[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\ProfileList]--> 最長資料夾 --> [ProfileImagePath] --> 將C:\Users\name1 修改成 D:\users\Name1
4. Restart computer
5. 以Administrator帳號登入
6. 移動資料夾 C:\Users\name1 --> D:\users\Name1
7. Restart computer
8. 以Administrator帳號登入
9. cmd --> 指令 MKLINK C:\users\Name1 D:\users\Name1
若提示檔案存在, 檢查 C:\users\Name1 是否已刪除
若出現"已建立 C:\users\Name1 <—> D:\Users\Name1"
10. 完成 --> Restart
11. 以 Name1 Login --> 關閉Administrator 帳號
標籤: Windows
2011年3月4日 星期五
2011年2月24日 星期四
1. 轉址
2. 封鎖滑鼠右鍵
語法貼於body框框中
oncontextmenu="return false" ondragstart="return false" onselectstart="return false"
標籤: Internet
2011年2月18日 星期五
狀態: 伺服器以無法路由的 IP Address 送出了被動式回應. 改為使用伺服器 IP Address.
指令: LIST
回應: 150 Data connection created for directory listing
錯誤: 連線逾時
錯誤: 無法取得目錄列表
FileZilla 設定上出了問題
步驟
編輯-> 設定 -> 連線 -> FTP -> 被動模式 -> 回復主動模式
即可取得目錄列表
標籤: Internet
2010年12月17日 星期五
1. 以檔案總管開啟 C:\Users\ABC 資料夾 --> 將ABC\ 內所有可見之子資料夾剪下
2. 開啟 D:\Users\ABC 資料夾 --> 貼上所有子資料夾
以上動作將資料轉移過程, Windows 會自動重新指向媒體櫃、桌面等儲存位置。
標籤: Windows


