2018年4月11日 星期三

以 Reed-Muench method 計算 TCID50

Reed-Muench Method
1.     計算距離值
[(感染力高於50%之佰分比)50% ] / [(感染力高於50%之佰分比) – (感染力低於50%之佰分比)]
2.     計算TCID50
取大於50% CPE之稀釋倍數之log值加上距離值
3.     Example (第一排取10 μl病毒液稀釋到90 μl的培養基中)

10-1
10-2
10-3
10-4
10-5
10-6
10-7
10-8
S1
S2
S3
S4
S5
Control
Ratio
100%
100%
80%
20%
0%
0%
0%
0%
距離值 (80% - 50%) / (80% - 20%) = 0.5
TCID50 = 10 (3+0.5) * 100= 105.5 = 3.16 x 105 / ml


2 意見:

匿名 提到...

算錯了吧,是 每 0.1 mL 有 1 TCID₅₀,這時你已經要除以 0.1,相當於乘以 10,不需要再乘 100。所以答案是3.16×10
^4TCID 50/mL

wojo 提到...

上面这位是对的。是3.16×10^4TCID 50/mL。
1. Calculate infection rate:
Infection rate = cumulative positive units / (cumulative positive units + cumulative negative units)

2. Identify dilutions above and below 50% positive, then calculate the proportionate distance (PD):
PD = (positive above 50% − 50%) / (positive above 50% − positive below 50%)

3. Calculate logID50:
logID50 = log(dilution with > 50% positive) + PD × (−log(dilution factor))

可以使用BioCalculator App快速计算。